دكتور محمد الخثعمي حاصل على بكالوريوس الطب والجراحة من جامعة الملك سعود بالرياض.
كذلك حاصل على البورد السعودي في أمراض الطب الباطني، بالإضافة إلى ذلك زمالة أمراض الجهاز الهضمي والكبد مع مرتبة الشرف.
من ناحية أخرى ساهم الدكتور محمد الخثعمي خلال فترة عمله الإكلينيكي لأكثر من ١٠ سنوات بمشاركات في العمل التدريبي والمؤتمرات العلمية وكذلك في الأعمال الإدارية والإشرافية (رئيس أقسام الباطنة، ومساعد مدير الشؤون الأكاديمية والتوعية الصحية، ومدير برنامج تدريب زمالة الجهاز الهضمي والكبد، وغيرها)